一句话来回答：林奈的分类系统影响太大了

鸟纲这个分类，来自 1758 年林奈建立的分类系统。

那时候，达尔文还没有出生。

进化论还要等一百年才会出现。

林奈当时看到鸟类：有羽毛，会飞，温血，下蛋。

看到爬行动物：有鳞片，冷血，爬行。

差别很明显。

所以他将鸟类分为独立的“鸟纲”（Aves）。

在当时，这种分类完全合理。

问题是，这个系统一用就是 260 多年。

全世界的生物学教科书、博物馆标本、科研论文，都在使用这套分类。

如果要改变它，需要重写几乎所有的生物学资料。

20 世纪以来，越来越多的证据告诉我们：鸟类，就是是恐龙的直接后裔。

2024 年，研究人员通过分析 363 种鸟类的基因组数据，科学家构建了迄今最完整的鸟类进化树。
研究证实，现代鸟类的所有主要类群都在恐龙灭绝后的 500 万年内快速分化演化。

而且。我们现在知道：

鸟类属于恐龙亚群 Maniraptora（手盗龙类），

而手盗龙类属于 Coelurosauria（虚骨龙类），

虚骨龙类属于 Theropoda（兽脚类），

兽脚类属于 Saurischia（蜥臀目）。

从进化的角度看，鸟类确实应该被分类为蜥形纲蜥臀目下的一个分支。

传统的林奈分类法基于形态相似性：

鸟类长得像鸟类，所以归为一类。爬行动物长得像爬行动物，归为另一类。

现代的系统发育分类法基于进化关系：

不管长得像什么，只要有共同祖先，就应该归为一类。

在系统发育分类中，只有单系群（包含一个共同祖先及其所有后代的群体）才被认为是有效的分类单位。

按照这个标准，传统的“爬行动物”分类就成了问题。

看个例子

如果我们将鳄鱼、蜥蜴、蛇、海龟归为“爬行动物”，但排除鸟类，这个“爬行动物”群体就是不完整的。

因为鸟类和鳄鱼的关系，比鳄鱼和蜥蜴的关系更近。

在系统发育学中，这被称为“并系群”（paraphyletic group）——包含共同祖先但排除了某些后代的群体。

这就像一个家庭聚会，爷爷奶奶和三个孙子都来了，但有一个孙子因为长得特别不像其他人，就被排除在“家族”之外。

这显然是不合理的。

那怎么解决？

在系统发育研究中，科学家倾向于使用反映真实进化关系的分类。

比如用“非鸟类恐龙”来指代那些已灭绝的恐龙，强调鸟类也是恐龙。

但在日常教学、博物馆展示、大众科普中，仍然保持传统的鸟纲分类。

因为这样更容易理解，也更实用。

即：

在系统发育研究中，鸟类被正确地视为恐龙的一个分支。

在传统分类和日常应用中，鸟类属于独立的鸟纲。