不会，但近亲繁殖会让桃花源对瘟疫的抵抗力变得非常脆弱。

这个瘟疫就是渔人传染的，文中捕渔人东晋太元年间（376-397 年）进入桃花源，距离秦末（公元前 210 年左右）大概 600 年。

经过 600 年的近亲繁殖，桃源人的免疫系统已经同质化，而且没有接触过 600 年间新发展的传染病，捕鱼人是他们遇到的第一个外人（乃不知有汉，无论魏晋）。

捕鱼人身上、衣服上带有肉眼看不见的传染病细菌与病毒，他走后，桃花源爆发了瘟疫，很快便传染至全村（村中闻有此人，咸来问讯），两三个月后便全部死光了。

就跟现在基因高度同质化的养鸡场、养猪场碰到鸡瘟、猪瘟，很容易团灭一样。

其实，桃源人本可以出源求救，但是因为渔人走后不久武陵一带汛期到来（桃花最繁盛的时候是 4 月，长江流域汛期从 4 月底开始），又缺少交通工具(船)，所以被活活困死。

汛期的到来，也是太守没有找到“桃花源”的原因，渔人原先留下的记号因为水位暴涨而淹没冲毁，于是“遂迷，不复得路”。

之后南阳的刘子骥过来寻找又没有找到，原因就很简单了。

东晋太元年间是公元 376-397 年，陶渊明写下《桃花源记》大约在宋永初二年(421 年)，至少相隔二十年。

陶渊明大概率认识刘子骥，而且眼看他“寻病终”，按照古人的信息传播速度和交通条件，刘子骥听到传言并过来寻找，差不多是几十年后的事情了，这个时候，即使他找到了桃花源，原先的“阡陌交通”也早已淹没在荒草之中了。

之后古代人口增长，桃花源所在的地方很可能会被后人重新耕种，成为现今沅水流域的一个村庄，但无论怎样都已是物是人非，原先的桃花源已经被掩埋在黄土之中了。

《桃花源记》 陶渊明
晋太元中，武陵人捕鱼为业。缘溪行，忘路之远近。忽逢桃花林，夹岸数百步，中无杂树，芳草鲜美，落英缤纷，渔人甚异之。复前行，欲穷其林。
林尽水源，便得一山，山有小口，仿佛若有光。便舍船，从口入。初极狭，才通人。复行数十步，豁然开朗。土地平旷，屋舍俨然，有良田美池桑竹之属。阡陌交通，鸡犬相闻。其中往来种作，男女衣着，悉如外人。黄发垂髫，并怡然自乐。
见渔人，乃大惊，问所从来。具答之。便要还家，设酒杀鸡作食。村中闻有此人，咸来问讯。自云先世避秦时乱，率妻子邑人来此绝境，不复出焉，遂与外人间隔。问今是何世，乃不知有汉，无论魏晋。此人一一为具言所闻，皆叹惋。余人各复延至其家，皆出酒食。停数日，辞去。此中人语云：“不足为外人道也。”
既出，得其船，便扶向路，处处志之。及郡下，诣太守，说如此。太守即遣人随其往，寻向所志，遂迷，不复得路。
南阳刘子骥，高尚士也，闻之，欣然规往。未果，寻病终，后遂无问津者。