从现已发现的地层中的化石记录来看，地球上就有古杯动物、三裂动物等生物整个门灭绝了，一些看起来特征区别于原核生物而又早于真核生物的古老生物可能整个界乃至整个域灭绝了。

在目前缺少化石记录的原始地球上，比现存生命的最后共同祖先（LUCA）先出现的许多生物的遗传信息可能没有延续到今天，那可能意味着地球上有多个域灭绝过。

目前看来业已灭绝的动物界门级分类：

• 古杯动物门、软舌螺动物门、叶足动物门（可能是并系群）、盾形动物门、三裂动物门、古虫动物门（有争议，有学者建议其为脊索动物门的亚门）

目前看来业已灭绝的植物界门级分类：

• 莱尼蕨门、三向蕨门、前裸子植物门、种子蕨门（有争议）、织丝植物门

其它界别的生物目前难以考察，但看起来没什么特别的理由认为它们的门级分类从未灭绝过。

既然地球上就这样了，无论宇宙中还有没有其他生物圈，地球生物圈就可以证明“宇宙中极可能有一些生物整个门或整个界地灭绝了”。

你可以预期，如果宇宙中有过其他的生物圈，那么根据宇宙中各种暴烈的天体活动表现出的破坏力，有可能有一些比我们先出现的生物圈里的所有物种业已集体灭绝。当然，其中也可能有少量超耐环境微生物或获得了同等以上的环境耐性的智能生物存在下来。

---

局部的疑似真核生物化石可以追溯到约 21 亿年前，例如 21 亿年前的疑似绿藻^[1]。最近二十年的研究认为真核生物很可能是在 16 亿年前到 21 亿年前出现的，不排除在那之前有一些“结构与原核生物有明显差异的生物”出现而又灭绝。

• 目前确定的最古老的真核生物化石是在加拿大的萨默塞特岛发现的 12 亿年前的红藻化石^[2][3]。
• 分子钟显示，红色植物和绿色植物是在 15 亿年前分家的^[4]，那么真核生物至少有 15 亿年历史。
• 在印度温迪亚山脉发现了 16 亿年前的疑似红藻化石^[5][6]。
• 在加蓬的页岩里找到了约 21 亿年前的疑似由真核生物留下的痕迹^[7]。

• 在南非找到了约 22 亿年前的可能是真核生物也可能是原核生物的化石^[8]。
• 在澳大利亚的页岩里找到了约 27 亿年前的疑似由真核生物留下的甾烷^[9]，但也有人怀疑该样本的可靠性。

目前，地球上似乎有一些多细胞生物门级分类只有一个物种：

• 微颚动物门，银杏门

此前，平板动物门也只有一个已知物种，后来随着研究深入从一个物种增加到三个。微颚动物可能还有其它物种等待发现。银杏门看起来确实只剩下银杏了，化石记录里有超过五十个灭绝物种。所以，你可以将银杏门当做“整个门处在灭绝边缘的植物”的案例。