元朝对于辽朝、金朝颇为重视，在修撰正史时，对宋、辽、金、元一视同仁，分别修撰了《宋史》、《辽史》与《金史》。但却未将同样立国百年的西夏列入正史行列。对此，李华瑞指出，元朝不修西夏国史，主要出于西夏不具有正统地位。另外，西夏屡降屡叛的经历，使以成吉思汗为首的蒙古人对西夏非常痛恨，成吉思汗曾言灭其国、灭其史。西夏被征服后，也遭到了大肆屠戮的命运，族众残存甚少。国史典籍也基本完全毁于战火。蒙古以宗王统治西夏故地，又由中央科以税收。而忽必烈与阿里不哥的战争也主要在西夏故地展开。这又使西夏故地惨遭涂炭。 

《肃州新志》所载可见蒙古对西夏杀戮之惨。“乱古堆。在城东南十五里，相传蒙古主铁木真以兵取肃州，杀戮甚众，尸积原野，掘大坑埋之。后凡无主骼骸，悉瘞于此，故名。一说此地土多高阜似垒，得名。” 

蒙古对西夏的刻意报复与大肆屠戮，都使党项这一民族遭到了毁灭性的打击。相应，包括河套在内的地区，由于缺少了西夏故民的屯垦，经济应倒退了许多。到了明朝虽然甘肃地区尚属可观，但河套却由于沙漠化，农耕传统不再延续