谢 @知乎动画 邀。哈哈，官方随机点名吗？
不一样的地方实在太多了。《银魂》动画里曾经吐槽过，还在连载的长篇漫画改编为动画时，经常有这样的问题：因为动画进度快要赶上漫画进度了，因此动画采取拖剧情、加原创剧情等等方式刻意再拉慢进度。
事实上，漫改、游戏改、轻改动画由于实质是版权授权再创作，理论上来说完全不按原作去拍动画也是有可能的——虽然一般不会那么做，但也不是没有例子。所以动画与漫画不一样实在是普遍的事情。
OP 的动画漫画的区别主要有以下几种吧：
第一，漫画出现的情节，动画有呈现，但改动了顺序。这在早期的动画里比较常见，比如动画里路飞小时候的事情（漫画第一话）和索隆上船的情节是通过回忆的形式，出现在初遇娜美的情节之后。
第二，动画按照漫画的情节去呈现，但添加了漫画里没有的细节。比如，德岛篇时，克尔拉去寻找走私罪证，漫画里只给出了克尔拉偷拍的画面，动画里让克尔拉好好地展现了一番打斗功夫。这种添加细节的做法还是很赞的，毕竟漫画和动画的表现方式不一样。
第三，动画大致按照漫画的情节去演示，但做了改动。比如阿拉巴斯坦篇，漫画里艾斯在油菜花港口遇见路飞等人后，寒暄几句、给了生命卡就又离开了，动画里艾斯却跟着路飞一行穿越了沙漠。
第四，动画完全原创章节。这主要是因为动画快追上漫画的进度了，不得已增加几话原创动画。但这种原创动画章节容易出问题，比如千年龙篇有条龙，后面庞岛篇漫画出来的时候却说世界上没有龙，庞岛上的龙都是人造的，并且路飞说之前从来没见过龙——这就尴尬了。
第五，漫画有的情节，动画没能展现。这主要是体现在漫画的扉页故事里，大部分的扉页故事都没能在动画里正式拍出，然而扉页故事实际上与正篇故事的联系特别紧密，没有这些故事的话，有些正篇故事的情节是很突兀的。所以我一直觉得奇怪，为何宁可原创动画章节，也不把扉页故事好好拍出来呢？
第六，也是比较容易出问题的一点，即动画制作组可能因为缺少与原作者的沟通，或者设定有变动，导致动画设定与漫画设定矛盾。最大的一个矛盾是罗宾的肤色。漫画里罗宾最初的造型是美国西部风，黑头发、梳着齐刘海，动画这里想当然地把她设定成肤色偏黑的拉丁美女样子，也是比较常见的形象。
然而后来尾田在 SBS 里却说罗宾的代表国家是俄罗斯……漫画封面给出的色彩设定也明明白白画出罗宾的白肤色。
然而动画人设不能随便改，所以动画里硬着头皮让罗宾顶着黑肤色，一直到顶上战争篇悄咪咪地给罗宾改了肤色，“两年后”所有人设都进化一代后就正式改回白肤色——这也让很多只看动画的观众诧异，怎么一下子变白了？很多人不能接受这种突然的改动，也有很多人称仍然喜欢黑皮罗宾。对此也只能苦笑待之。
类似的情况出现在白胡子第一番队队长马尔科身上。马尔科在漫画里第一次出场时比较挫，没给特写。
所以动画制作方以为这可能是个路人，随便给了个造型。
白胡子和红发见面后，给了马尔科的介绍，这脸是打得啪啪的……
最近几年的动画制作方大概是与原作者沟通较多，这种错误出现得少了。但由于尾田本人的设定也可能会改，仍然会坑动画组一把。最新的情况有如下例子：
御田大人，漫画里最早给的剪影是这个——
动画依葫芦画瓢，加了点戏和人物形象细节，没毛病。
但，尾田画出来御田的正脸后，成了这个样子——
……发型完全不对，当然这个不能完全算动画的锅。
第七，某些不在漫画正篇里出现的外传，动画拍出来了。比如最近的动画把尾田早年画的 OP 漫画原型《Romance dawn》拍在了动画里，不清楚情况的观众看了可能会一脸懵逼。不过这个确实是对资深海迷来说非常有趣的东西。
最后一点，是动画与漫画差距最明显的效果对比——拖戏。这里引用 @不懂 的一个回答：
除了她说的这些，比较明显的还有最近和之国篇路飞对蝙蝠 smile 能力者一战，漫画里几个分镜的事，在动画里变成了几分钟的鏖战，蝙蝠同志与路飞 + 索隆打成了五五开甚至还有所压制……也因此这位仁兄被网友戏称为“第六皇”。类似的长篇漫改动画多多少少有这种问题，比如龙珠动画里双方互相瞪眼五分钟再开打，灌篮高手动画里则是扔一个三分球、回忆两集，足球小将动画更是半个球场跑出了地平线的感觉。
不管怎样，动画 OP 在日本也算国民级动画了，最近的和之国篇制作似乎是外包给了中国的公司，技术上没什么问题，和之国篇刚开始的几话非常惊艳，解决了拖戏会好很多。
祝大家看得开心。